Nach dem Rückzug des Hochwassers können sich für Hausbrunnen hygienische Risiken ergeben. Eine Verunreinigung des Trinkwassers durch zugeführte Schlämme und eine Belastung mit Keimen sind möglich. Deshalb sollte bei unklarem Informationsstand das Wasser generell nur abgekocht, d.h. nach 3 min Siedezeit, dem direkten menschlichen Gebrauch dienen. Besondere  Vorsicht ist geboten bei der Zubereitung von Säuglingsnahrung, da auch bei optisch unauffälligem Wasser nicht auszuschließen ist, dass es zu Verunreinigungen durch Auswaschungen aus dem Boden (z.B. Nitrat) gekommen ist.
Bei groben Verunreinigungen sollte immer  auf Trinkwasser aus zentralen Anlagen bzw. Mineralwasser aus Flaschen zurückgegriffen werden.
Überflutete Brunnen sind vor der Wiederinbetriebnahme intensiv zu reinigen und zu desinfizieren. Gegebenenfalls sollte ein Fachmann (Brunnenbauer) zur Beratung bzw. Brunnensanierung herangezogen werden.
Auf jeden Fall wird jedem Brunnenbesitzer empfohlen, eine Trinkwasseranalyse über die bakteriologische und sonstige Unbedenklichkeit seines Brunnenwassers erstellen zu lassen. Beratungen zu Probenentnahmen und Adressen von Untersuchungsstellen erhalten Sie im Fachdienst Gesundheit, Tel.-Nr. 586 829.